解决return code from pthread_create() is 22报错问题

今天在处理芯片数据，在使用rma方法对数据进行预处理时报错，试了非常多的方法，记录一下。

可能时rma函数会涉及调用多线程的操作，这一过程会产生冲突。此错误表示在规范化过程中创建新线程时出现问题，特别是与 pthread_create（） 函数有关。为了解决这个问题，我们可以在负责 normalize.quantiles 函数的 preprocessCore 包中禁用线程。禁用线程将强制包以单线程模式运行，这可以避免 pthread_create（） 错误。

解决方法如下：

#设置禁用线程的配置参数：
configure.args <- c(preprocessCore = "--disable-threading")
options(configure.args = configure.args)
#重新安装 preprocessCore 包：
renv::install("bioc::preprocessCore", rebuild = TRUE, force = TRUE, update = TRUE, type = "source")

最后一步，需要重启R（需要耐心等待一会儿）

重启之后，再次运行rma函数，发现报错消失，问题成功解决！

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此解决方案通过将包限制为单线程操作来有效解决 pthread_create（） 错误。虽然这可能会在多核环境中略微降低性能，但它确保了稳定性并避免了导致错误的线程问题。

至于取消以上操作，可以运行如下代码，记得仍需要重启R：

options(configure.args = NULL)
renv::install("bioc::preprocessCore", rebuild = TRUE, force = TRUE, update = TRUE, type = "source")

参考：

[1] 处理 R 中的“pthread_create（）”错误 |基因组学 AI --- Handling the `pthread_create()` Error in R | Genomics AI (chaochungkuo.github.io)