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解决Rdkit Explicit valence for atom # 1 C, 5, is greater than permitted，价键不对的问题

news 2025/2/23 13:37:27

本文主要介绍如何利用RDKit解决化合物SMILES表示中出现的原子价态错误，报错Explicit valence for atom # 1 C, 5, is greater than permitted。

问题现象：

mol = Chem.MolFromSmiles("C[CH2+]1(C#N)CC1")  #运行后报错如下 
>>> [11:09:12] Explicit valence for atom # 1 C, 5, is greater than permitted


http://www.mrgr.cn/news/31281.html

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